Od januarja 1993 do odstopa junija 1994 je bil Ivo Bizjak minister za notranje zadeve v Vladi RS. Ta funkcija pomeni prelom v njegovi karieri. Dne 18. marca 1994 je v pravem (proti)obveščevalnem spopadu Bizjakovega ministrstva in ministrstva za obrambo, ki ga je vodil Janez Janša, izbruhnila afera Depala vas.
Afera Depala vas omogočila centrom moči bivšega režima vrnitev na oblast
Jože Možina poudarja usodnost Depale vasi. Po njegovem mnenju je bil to prelomni trenutek v slovenski politiki, ker je vrnil oblast centrom moči bivšega režima. Možina je v dokumentarcu Urok Depale vasi (2014) predstavil razsežnosti zarotniškega dogajanja, katerega cilj je bila odstranitev Janše iz vlade. Med drugim je nekdanji agent nekdanje protiobveščevalne službe Jugoslovanske ljudske armade za slovenske igralce proti Janši pripravil scenarij rušenja. Posebno pozornost so namenili novinarjem, ki naj bi jih sprovocirali k obsojanju Janše.
V nepregledni množici zavajanja, podtikanj, ki se do dandanes vali iz kriminalno-političnega in medijskega podzemlja, se je težko znajti. V velikih igrah tedaj omenjajo afero Hit, Safty, trgovino z orožjem in druge spopade, v katerih se oblikuje še danes živo nasprotje, ki ga simbolno poosebljata Janez Janša in Milan Kučan.
Nobeden od udeležencev afere ni bil obsojen, številni so odleteli s položajev. Prvi Janez Janša. Bizjak je odstopil potem, ko so policijski specialci maja 1994 poskušali ropati v Celovcu.
Če Janša očita Bizjaku, da je igral proti njemu, Bizjak nakazuje, da je z Depalo vasjo Janša dobil odskočno desko za boljše volilne uspehe svoje stranke …
Celoten prispevek Ivo Bizjak je bil kot notranji minister v Drnovškovi vladi vpleten v afero Depala vas je objavil Časnik.